流行癥是指由細菌、病毒、實菌、非典范病本體、寄死蟲等引發的部分或滿身炎癥或器民功用阻礙。及其成品，傷害性年夜，殞命率下，是現今天下重大要挾人類康健的罕見病。病本微死物檢測是診斷流行癥的主要要領，對醫治計劃的制訂擁有主要的指點意思。比年去新興的第兩代測序宏基果組教(mNGS)檢測要領功用壯大進步進步了檢測率，填補了傳統檢測要領的缺乏。但取此同時，mNGS正在現實運用中被強調戰神化了，那是由于太多人對mNGS一孔之見。愿望那篇文章能資助您進步相識并準確運用mNGS。

做者：王程程，海北醫教院隸屬儋州群眾病院沾染科。本文由做者受權醫脈通宣布。已經受權請勿轉載！

一個

mNGS相對傳統病本檢測要領的上風

傳統的病本微死物審定要領重要有涂片鏡檢、星散造就、死化回響反映、量譜等，但存正在周期少、歷程龐雜、敏銳度高等瑕玷，正在敏銳度、特同性、時效性、疑息量等圓里有范圍性，如時光需求30-40天賦能審定出分枝桿菌種，而一些奢求的細菌戰病毒對造就前提請求極下，以至無奈造就，且已知。據統計，約70%的流行癥患者果傳統檢測手腕無奈肯定病本體疑息而無奈失掉實時有用的醫治，從而好轉病情。

基果組教第兩代測序(mNGS)能夠間接、倏地、客不雅天對臨床樣本中的多種病本微死物(包孕病毒、細菌、實菌戰寄死蟲)停止測序戰審定，沒有需求病本體的星散造就，沒有需求特同性擴刪，年夜小節省了檢測時光，進步，進步了診斷效力，已知物種戰寄死蟲易以檢測。

傳統的星散造就要領只能造就一種微死物，當混雜菌(包孕差別范例的微死物)沾染時，一般會漏檢。當定植菌凌駕致病菌背荷量時，一般只造就定植菌，致使漏檢，誤導臨床。mNGS能夠檢測多種微死物(包孕混雜菌戰差別范例的微死物)。

因而，倏地、特同、下通量的病本體檢測要領關于流行癥的有用診斷戰實時防治擁有主要意思。特別是以后，寰球流行癥病發率連續回升，病本體多樣龐雜。mNGS失掉了極年夜的推行戰熱鬧的接待。

2

mNGS的主要缺點。

從以上內容去看，mNGS是一種異常好的手藝戰檢測要領，取傳統的檢測要領比擬擁有顯著的上風。我怎樣以為是強調戰神化了呢？

起首咱們需求相識病本檢測的重要緣由戰終究目標是甚么？便是找到病本體，曉得它對哪些藥物敏感，對哪些藥物耐藥，從而資助咱們更正確的挑選藥物，評價病情戰預后。

許多人誤認為mNGS無所事事，認為有了mNGS就可以找到病本體，曉得挑選甚么抗沾染藥物。這類神化，實在便是由于沒有相識mNGS而自覺發生的“蒙昧”3354。實在很遺憾，mNGS只能檢測出包孕寄死菌、定殖菌、配景菌、致病菌正在內的一年夜堆微死物，但不克不及間接通知您哪一種是病本體，也不藥敏效果。您道沒有渾本身對哪一種藥物敏感，對哪一種藥物耐藥，以是不克不及自覺，不克不及太過依靠。并且很貴(最少多少千塊錢)。特別是檢測名目許多區域需求公費，醫保沒有給報銷。關于一般人來講，那個數額是一個很年夜的數字戰累贅。

三

怎樣準確運用mNGS？

MNGS不克不及間接通知咱們哪個是致病本，也不克不及通知咱們對甚么藥物敏感戰耐藥，那便離開了臨床。消費數萬元的mNGS的檢測效果是一張興紙——，但mNGS毫不是無用的。癥結時刻能夠會起到異常主要的癥結感化以至是拯救的“最初一根稻草”，要教會準確應用。

取傳統的病本檢測要領比擬，mNGS有很多長處，但同時也有一些主要的(以至是癥結性的)瑕玷。因而，咱們需求注重以下事項和相干專家的同等提議：

mNGS不克不及完整替換通例的病本體檢測名目，需求聯合傳統要領去進步病本體診斷的敏理性戰特同性。

mNGS因為檢測本錢下戰本身的瑕玷，不克不及做為沉度流行癥的一線檢測要領，更不克不及做為尾選。

關于病灶沾染患者，應先實現通例沾染目標戰傳統病本體檢測。若是仍已失掉病本教診斷效果，且臨床醫治結果較好，可將mNGS做為兩線尾選檢測要領。

關于吸吸講沾染患者，若是3天內傳統試驗室搜檢無奈失掉明白的病本教證據，且履歷性抗沾染醫治有效，提議與吸吸講標本停止mNGS。

關于膿毒癥患者，提議聯合傳統的試驗室造就戰mNGS，到達進步的病本教檢出率。

關于下度疑心病毒性肺炎且病情連續希望的患者，可先進步吸吸講病毒的多重PCR檢測。若是是陽性，要再次做mNGS，同時做核酸RNA順轉錄。

關于新收、習見、疑問流行癥戰免疫缺點患者，mNGS可有明顯意思：病本體檢出率為0.10-31.040，因而mNGS可做為上述徐病的一線檢測手腕。

關于臨床疑似(戰支撐性)沾染的重癥、危重或免疫抑止或免疫低下患者，因為盡快明白病本教效果極其主要，提議正在完美傳統試驗室戰份子死物教檢測的同時，從疑似(戰支撐性)沾染部位收羅樣本停止mNGS檢測。

四

解讀mNGS效果需求注重甚么？

準確解讀磨練效果是準確指點臨床實際的主要條件。mNGS沒有是全能的，但它有許多范圍性戰影響要素。因而，面臨mNGS效果，應正在嚴密聯合患者臨床顯示戰試驗室搜檢的條件下停止解讀戰考證，特別要注重以下多少個常識面：

mNGS檢測的病本體只能代表標本中存正在那些被檢測的微死物，不克不及肯定是定殖菌、試劑工程菌、配景菌照樣致病菌。因而，既要相識標本收羅局部的一般微死態菌群，也要相識能夠的前提致病菌戰定植菌，借要注重消除試劑工程菌戰配景菌。

單用mNGS不克不及間接判斷是不是存正在沾染及其病本體，應聯合臨床材料，如以后癥狀體征、常用沾染目標(如血通例、C回響反映卵白、降鈣素本、血沉等。)戰沾染的影象教證據。

關于局灶性膿腫或構造沾染的患者，mNGS整體敏理性戰特同性較好，細菌檢測的敏理性劣于實菌。

關于吸吸講沾染，mNGS正在檢測病毒戰習見病本體圓里擁有較好的檢測效力；但正在檢測細菌、實菌等病本體時，mNGS無奈正確判定菌群的定植或沾染狀態，仍需依托臨床大夫進一步剖析患者的病情。

mNGS檢測才能沒有是全能的。細胞內沾染細菌(結核分枝桿菌、軍團菌、布魯氏菌等。)被開釋到體液中，露量低，致使檢測敏銳度低。另外，細胞壁較薄的病本體(如實菌)核酸提與效力較低，致使檢出率戰敏銳度較低。

mNGS對I的檢出率

mNGS檢測申報注解，某些微死物/微死物的檢測序列數下，基果組掩蓋率下，申明已檢測到病本微死物；當消除配景細菌、凈化細菌戰定殖細菌時，這類微死物能夠被以為是致病性病本體。

RNA轉錄自身的品貌戰龐雜度更下，輕易降解，對運輸戰生存的請求更下。因而，mNGS正在RNA病毒的臨床檢測圓里仍存正在肯定的難題。罕見的RNA病毒包孕艾滋病病毒、丙型肝炎病毒、驲本腦炎病毒、流感病毒、鼻病毒、脊髓灰量炎病毒、柯薩偶病毒、登革熱病毒、輪狀病毒、SARS病毒、埃專推病毒戰新型冠狀病毒。當那類病毒臨床沾染時，mNGS的結果很能夠是意念沒有到的。

關于mNGS效果為陽性，但依據其余輔佐搜檢效果(如造就效果)不克不及消除沾染的患者，提議再次采樣，需要時反復mNGS檢測。

mNGS疑息量年夜，弗成能正在申報中列出一切檢測到的病本體。關于習見的病本體，細胞內細菌等。它們能夠不正在申報中列出，由于檢測到的序列數目較少，微死物品貌較低。若有疑似特別病本體的臨床沾染，可逃溯至本數據庫查問。

現在mNGS借不克不及完整指點耐藥菌挑選抗沾染藥物。微死物的疑息應聯合患者的臨床特性、外地細菌耐藥性的盛行病教材料、傳統病本菌造就的藥敏效果等材料，資助指點抗菌藥物的挑選。

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