魚缸里的糞便是需要清理的，否則時間長了會破壞水質，影響金魚的生長。可選擇以下方法清理：

滴管清理：捏癟滴管的橡膠球，排除橡膠球里的空氣，將滴管另一端對準糞便然后放松橡膠球，糞便就會被吸入滴管。

注射器清理：將一次性注射器的針頭換成塑料軟管，然后把軟管另一端對準糞便，吸入即可。

水管清理：準備一個空的容器，放在低于魚缸位置的地方，然后將軟管一端放進魚缸，另一端拿在手上，對著軟管輕輕吸一口氣，這時可以看到魚缸中的水會流進軟管，此時馬上將軟管出口對準空容器，讓水從魚缸持續流進去，最后將魚缸中的軟管端口，對準魚缸中的魚屎，即可看到魚屎也會隨著水流流進水盆中。需要注意的是，在吸氣時不要太用力，以免臟水被吸進嘴里。

除了清理糞便外，魚缸還要定期進行換水。夏天三到四天換一次，春秋季一周一次，冬季半個月一次，每次換水三分之一左右。